Tim pemimpin STT Jaffray periode 2006-2011 sebagai berikut:
Ketua : Pdt. Dr. Daniel Ronda, Th.M.
Dir. Pascasarjana : Pdt. Dr. Daniel Ronda, Th.M.
Pembantu Ketua I : Pdt. Jermia Djadi, M.Th.
Pembantu Ketua II : Pdt. Peniel Maiaweng, M.Th.
Pembantu Ketua III : Ev. Wessley Penias, M.Th.